1856年初，在杨秀清的部署下，陈玉成、李秀成等五位年轻将领带领两万多太平军悄无声息地出现在镇江，此时的镇江被清兵围的水泄不通，已经到了被攻破的边缘了，面对阵容强大的太平军援军，清兵担心被内外夹击，于是把周边的兵力都抽调过来了，准备一决雌雄。不过，等清兵各路援兵都出动后，陈玉成、李秀成等人的突然跳出镇江，横渡长江，直扑清兵在扬州的军事要塞江北大营，措手不及的清兵很快就溃败了，江北大营被攻破。不久之后，又以调虎离山之计，打败了清将向荣经营的江南大营，向荣急火攻心而死。

杨秀清经过这一连串的军事行动，不仅把清兵围困在太平天国天京附近的兵营一扫而空，而且很大程度上杀伤了清兵实力，一些清兵将领在混乱中战死，很长时间内，清朝都没能恢复元气，请朝廷一片恐慌，咸丰皇帝也气急败坏地撤职查办了很多清兵头领，反观太平天国，却由此进入了国势、军势的全盛。 从太平天国定都天京以来，杨秀清就是太平天国实际上控制人，他不但可以名正言顺地节制韦昌辉、石达开等人，代理了天王洪秀全的所有职责，还拥有“天父下凡，宣告上谕”的特权。这次攻破清兵的江南江北大营，让东王杨秀清的威望更上一层楼了。

在半年前，因为不满洪秀全把自己府上的女官调到天王府任职，杨秀清不但以“天父下凡”的名义，重新安排了四位女官的职务，还直言不讳地拷问洪秀全的罪过，要打洪秀全的屁股，而洪秀全也只能跪在地上，求天父开恩。杖责洪秀全的事情过去之后，军事上的大获全胜让杨秀清更加目空一切了，口口声声认为太平天国的江山是自己打下来的。

对于韦昌辉、石达开等王，杨秀清更是不放在眼里。一次杨秀清的远亲叔叔，因为秦日纲的马夫见了他行礼，而大发雷霆，不仅把马夫打了两百大棍，还蛮横无理地要求当时掌管刑事的黄玉昆治马夫的死罪，黄玉昆是石达开的老丈人，为人也比较正直，所以驳回了无理的诉求。而杨秀清的远亲叔叔，不依不饶地向杨秀清打小报告，杨秀清也借题发挥，当着韦昌辉、石达开，将黄玉坤打了三百杖并且削去爵位，马夫被凌迟处死，而受到牵连的人，诸如秦日纲打了一百杖，陈承瑢打了二百杖。

可以这么说，在太平天国内部，杨秀清的权势几乎无人能敌，也没谁能与他抗衡。不过，在天京事变中，韦昌辉却能在一夜之间把杨秀清之流赶尽杀绝，连府上的佣人都无一幸免，说起来也比较悲哀。 1856年，洪秀全明面上加封杨秀清为万岁，暗地里却向韦昌辉、石达开、秦日纲等太平军将领发出了勤王的密诏，要求诸王发兵诛杀杨秀清，而此时的杨秀清并没有感到危机的逼近，在他看来，太平天国中还没有人敢动他，况且整个太平天国的将领一半以上都是他提拔的，都唯他是从。

不过，杨秀清却低估了洪秀全的阴险，一方面洪秀全纵容杨秀清的嚣张与跋扈，一而再地示弱，把自己塑造成受害者的形象，等杨秀清与所有人都结怨之后，洪秀全趁机而起，让掌握天京城门钥匙的陈承瑢夜间打开城门，让韦昌辉、秦日纲等人的亲兵趁夜进城，全副武装，突袭了杨秀清。

这场突袭如此高效，还有一个原因让人倍感心酸，那就是杨秀清身边的大将此时刚攻破江南江北大营不久，还在外作战，而留守杨秀清东王府的兵力，并不是精锐，再说，天下未定，杨秀清也不可能天天防着自己人的突袭。